La CES finance ses activités et rémunère son personnel par l'intermédiaire des cotisations de ses organisations affiliées, qui sont proportionnelles au nombre d'adhérents de ces dernières. Elle bénéficie en outre d'un soutien financier de la part de l'Union européenne, entre autres des fonds pour les réunions du dialogue social, l'information et la consultation des travailleurs ainsi que les activités de formation.